O Cremego tem como principal atribuição a busca pela excelência do exercício da medicina e o acesso à saúde de qualidade para os cidadãos. Recebe, apura e julga denúncias relacionadas à má conduta profissional de acordo com o Código de Ética Médica, resoluções e normas publicadas pela instituição e pelo Conselho Federal de Medicina (CFM). Segundo estatísticas do Setor de Processos da entidade, entre 1998 e 2002, foram julgados 101 processos ético-penais resultando em 69 absolvições. Destas, apenas quatro recorreram. Ao todo, foram aplicadas 35 penalidades. Segundo o corregedor de Processos, Breno Prado de Sousa, encontram-se no Cremego 221 processos ético-profissionais em andamento, 27 com relatores e 10 com revisores.